Кеден органдарының тәуекелдерді басқару жүйесін пайдалануының негізгі мақсаттары:
- 1) кедендік бақылаудың тиімділігін қамтамасыз ету;
- 2) деңгейі жоғары тәуекел салаларына назарды шоғырландыру және кеден органдарының ресурстарын тиімді пайдалануды қамтамасыз ету;
- 3) тәуекелдерді барынша азайту жөніндегі шараларды қолдану қажеттілігі анықталмаған тауарларды Еуразиялық экономикалық одақтың кедендік шекарасы арқылы өткізуді жеделдету және оңайлату үшін жағдайлар жасау болып табылады.